การกำหนดเลขรหัสประจำตัวผู้สมัครสอบ ประกอบด้วยเลข 9 หลัก ซึ่งเป็นแบ่งเป็น 3 ส่วน
ส่วน ก (2 หลัก) เลข 46-99
หมายถึง ปี พ.ศ. ที่สมัครสอบ โดยใช้เลข 2 ตัวท้ายของปี พ.ศ.
ส่วน ข (3 หลัก) เลข 001-999
หมายถึง รหัสประจำสถาบันที่สภาเภสัชกรรมกำหนดให้ โดยเรียงตามอักษร ดังนี้
010 จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
020 มหาวิทยาลัยขอนแก่น ภาคปกติ
021 มหาวิทยาลัยขอนแก่น ภาคสมทบ
030 มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
040 มหาวิทยาลัยนเรศวร
050 มหาวิทยาลัยมหาสารคาม
060 มหาวิทยาลัยมหิดล หลักสูตรปกติ
061 มหาวิทยาลัยมหิดล หลักสูตรพิเศษ
070 มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ หลักสูตรปกติ
071 มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ หลักสูตรพิเศษ
080 มหาวิทยาลัยศิลปากร ภาคปกติ
081 มหาวิทยาลัยศิลปากร ภาคสมทบ
090 มหาวิทยาลัยสงขลานครินทร์
100 มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี หลักสูตรปกติ
101 มหาวิทยาลัยอุบลราชธานี หลักสูตรพิเศษ
200 มหาวิทยาลัยรังสิต
300 มหาวิทยาลัยหัวเฉียวเฉลิมพระเกียรติ
510 มหาวิทยาลัยในฟิลิปปินส์
511 มหาวิทยาลัยในอินเดีย
512 มหาวิทยาลัยในญี่ปุ่น
513 มหาวิทยาลัยอื่นๆในเอเซีย
520 มหาวิทยาลัยในอเมริกา
530 มหาวิทยาลัยในยุโรป
540 มหาวิทยาลัยในออสเตรเลีย นิวซีแลนด์
ส่วน ค (4 หลัก) เลข 0001-9999
หมายถึง เลขลำดับของผู้สมัครสอบในปี พ.ศ.นั้น